Živá půda obsahuje rozmanité populace bakterií, hub a mikroorganismů, které spotřebovávají a přeměňují živiny a minerály na sloučeniny snadno dostupné pro rostliny. V lžičce zdravé půdy je více půdních mikroorganismů než lidí na zemi. Miliony druhů a miliardy organismů – bakterie, řasy, mikroskopický hmyz, žížaly, brouci, mravenci, roztoči, houby a další. Vermikompost, vyprodukovaný trávicím traktem žížal mnoho z těchto mikroorganizmů obsahuje a zvyšuje množství prospěšného humusu v půdě. Tyto jsou nezbytné pro zdraví půdy a hlavním předpokladem pro zdraví rostlin.
Mikrobiologie je novou devizou moderního zemědělství. Vznikající postupy regenerativního zemědělství jsou navrženy tak, aby omlazovaly půdní mikrobiologii a podporovaly biologickou rozmanitost zlepšující zdraví půdy a tím její úrodnost. Pěstitelé se stále více zaměřují na zlepšování celkové kvality svých plodin, aby dosáhli vyšších výnosů a kvality, a odlišili své produkty na trhu. Zlepšení půdní mikrobiologie pomocí vermikompostu může zvýšit výnosy a zlepšit kvalitu.